腐乳接种的菌种一般是霉菌，霉菌是丝状真菌，霉菌在豆腐上生长，通过豆腐给霉菌提供营养物质，而霉菌在生长过程中会分泌蛋白酶和脂肪酶，蛋白酶会将蛋白质分解成小分子的肽和氨基酸，脂肪酶会将脂肪分解为甘油和脂肪酸，最后变成腐乳。