酶的组成由碳、氢、氮、氧原子组成的碳化合物即氨基酸。基本上构成氨基和羧基原子团，这是根据结合后的形态制作的。所用原子的种类大约有300多种。

这其中有20种氨基酸是人体所使用的，50多个这样的氨基酸分子结合在一起，像扭转项链一样复杂的连接起来而构成蛋白质。不同种类的氨基酸的组合构成各种各样的蛋白质。肌肉当然是如此，而胶原以及某些荷尔蒙激素也是由蛋白质组成的。所有的酶也都是蛋白质。根据酶的种类，有的是由200或300种氨基酸连接而成，有的还是非常大的高分子构造。