在二十四史中，《明史》被列为编纂得最仔细因而也是最可靠的史书之一。

正史对明朝历史所作的解释，是根据清朝政府官方的新儒学正统观念。在这方面某种偏见是可以预料的。凡是涉及晚明时期明帝国与满洲和蒙古的关系的题目，其论述是偏颇的。

《明史》部分内容有“偏颇”之处，例如抗倭名将张经之冤死，《明史》归罪于内阁首辅严嵩，称“嵩皆有力焉。”，“时人多为其称冤”。但据时人王世贞指出，张经之死与事实上与徐阶的挑拨有很大关系。《明史》成于众人之手，编修时间过长，被魏源批评其列传繁冗，指出“食货、兵政诸志随文钞录，全不贯串”。

负责纂修明史的官员遵照康熙帝为尊者讳的旨意，尽量少记载明朝皇帝的阴暗面。为了掩盖明代皇帝的一些暴虐或昏庸行为，相关官员便把皇帝所犯的错误及责任推到大臣及太监身上。