申请专利费用计入什么科目分三种情况：

1、如果形成了一个专利。那么就作为这个专利的成本一项，合并其他为形成这项专利的费用一起。借：无形资产贷：银行存款

2、如果没有形成企业的一个专利，那么可以直接进管理费用。借：管理费用贷：银行存款或库存现金

3、如果是为企业研发某个科研项目而申请的专利费用可做到研发支出科目最后结转到管理费用科目。借：研发支出贷：现金或或银行存款借：管理费用-研发支出贷：研发支出

法律依据：

《专利法》第十二条

任何单位或者个人实施他人专利的，应当与专利权人订立实施许可合同，向专利权人支付专利使用费。被许可人无权允许合同规定以外的任何单位或者个人实施该专利。